Gastrointestinal cerrahi vücudun sindirim ile ilgili bölümlerinin cerrahi tedavisidir. Buna yemek borusu, mide, ince bağırsaklar, kalın bağırsak ve rektum dahildir. Ayrıca karaciğer, safra kesesi ve pankreas da sindirim sitemi içinde değerlendirilir. En önemli ameliyat sebebi olarak sıklıkla karşımıza bu organların kanserleri çıkmaktadır.